Learn to use tools from the Bioconductor project to perform analysis of genomic data. This is the fifth course in the Genomic Big Data Specialization from Johns Hopkins University.
Offert par
Spécialisation Science des données génomiquesUniversité Johns-HopkinsÀ propos de ce cours
13,145 consultations récentes
Certificat partageable
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Cours 6 sur 8 dans le
Dates limites flexibles
Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.
Approx. 9 heures pour terminer
Anglais
Sous-titres : Français, Portugais (européen), Russe, Anglais, Espagnol
Compétences que vous acquerrez
BioinformaticsBioconductorGenomicsR Programming
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Offert par
Université Johns-Hopkins
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
3 heures pour terminer
Week One
The class will cover how to install and use Bioconductor software. We will discuss common data structures, including ExpressionSets, SummarizedExperiment and GRanges used across several types of analyses.
3 heures pour terminer
16 vidéos (Total 126 min), 3 lectures, 1 quiz
2 heures pour terminer
Week Two
In this week we will learn how to represent and compute on biological sequences, both at the whole-genome level and at the level of millions of short reads.
2 heures pour terminer
8 vidéos (Total 81 min)
2 heures pour terminer
Week Three
In this week we will cover Basic Data Types, ExpressionSet, biomaRt, and R S4.
2 heures pour terminer
9 vidéos (Total 79 min)
2 heures pour terminer
Week Four
In this week, we will cover Getting data in Bioconductor, Rsamtools, oligo, limma, and minfi
2 heures pour terminer
7 vidéos (Total 81 min), 1 lecture, 1 quiz
Avis
Meilleurs avis pour BIOCONDUCTOR POUR LA SCIENCE DES DONNÉES GÉNOMIQUES
par JK30 août 2016
I think it is a good class overall but the pace is fast and the resources that can help you is lacking. This will be good for someone who already kind of understands bioconductor.
par GK27 août 2019
Before you can run, you must learn to walk. Kasper's well paced tutorials will give you confidence using the tools you need for genomic study.
par MA11 mars 2016
Excellent introduction to Bioconductor. Thanks to the team. However, absence of inputs from TA or Instructor was felt in the discussion.
par AB11 avr. 2018
Amazing course, motivated me to use bio conductor for descriptive seq studies of DNA.
À propos du Spécialisation Science des données génomiques
With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome.
Foire Aux Questions
Quand aurai-je accès aux vidéos de cours et aux devoirs ?
À quoi ai-je droit si je m'abonne à cette Spécialisation ?
Is financial aid available?
Puis-je obtenir des crédits universitaires si je réussis le Cours ?
D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.
