This class provides an introduction to the Python programming language and the iPython notebook. This is the third course in the Genomic Big Data Science Specialization from Johns Hopkins University.
Ce cours fait partie de la Spécialisation Science des données génomiques
Python for Genomic Data Science
Offert par
À propos de ce cours
21,257 consultations récentes
Compétences que vous acquerrez
BioinformaticsBiopythonPython ProgrammingGenomics
Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
Semaine
12 heures pour terminer
Week One
This week we will have an overview of Python and take the first steps towards programming.
5 vidéos (Total 58 min), 3 lectures, 2 quiz
5 vidéos
Lecture 2.1 - First Steps Toward Programming Part 110 min
Lecture 2.2 - First Steps Toward Programming Part 215 min
Lecture 2.3 - First Steps Toward Programming Part 3 (8:57)8 min
Lecture 2.4 - First Steps Toward Programming Part 4 (9:58)9 min
3 lectures
Welcome10 min
Pre-Course Survey10 min
Syllabus10 min
2 exercices pour s'entraîner
Lecture 1 Quiz6 min
Lecture 2 Quiz24 min
Semaine
21 heure pour terminer
Week Two
In this module, we'll be taking a look at Data Structures and Ifs and Loops.
4 vidéos (Total 50 min), 2 quiz
4 vidéos
Lecture 3.2: Data Structures Part 2 (10:41)10 min
Lecture 4.1: Ifs and Loops Part 1 (11:26)11 min
Lecture 4.2: Ifs and Loops Part 2 (15:28)15 min
2 exercices pour s'entraîner
Lecture 3 Quiz20 min
Lecture 4 Quiz20 min
Semaine
31 heure pour terminer
Week Three
In this module, we have a long three-part lecture on Functions as well as a 10-minute look at Modules and Packages.
4 vidéos (Total 38 min), 2 quiz
4 vidéos
Lecture 5.2: Functions Part 2 (8:20)8 min
Lecture 5.3: Functions Part 3 (13:24)13 min
Lecture 6: Modules and Packages (10:32)10 min
2 exercices pour s'entraîner
Lecture 5 Quiz20 min
Lecture 6 Quiz12 min
Semaine
42 heures pour terminer
Week Four
In this module, we have another long three-part lecture, this time about Communicating with the Outside, as well as a final lecture about Biopython.
4 vidéos (Total 46 min), 2 lectures, 3 quiz
4 vidéos
Lecture 7.2: Communicating with the Outside Part 2 (7:38)7 min
Lecture 7.3: Communicating with the Outside Part 3 (17:42)17 min
Lecture 8: Biopython (13:32)13 min
2 lectures
Final Exam Instructions10 min
Post Course Survey10 min
3 exercices pour s'entraîner
Lecture 7 Quiz10 min
Lecture 8 Quiz10 min
Final Exam (Read Instructions First)20 min
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Meilleurs avis pour Python for Genomic Data Science
A very good course for its length and the amount of time it requires. It improved my python skills and knowledge of Genomics. I'm more engaged in my pursuits than before taking the course.
Easy to understand and very powerful examples. Not just it made me familiar with python, it also made it easy for me to teach to my students and inspire them to pursue python further.
Enseignants
Mihaela Pertea, PhD
Assistant ProfessorCenter for Computational Biology
Steven Salzberg, PhD
ProfessorBiomedical Engineering, Computer Science, and Biostatistics
À propos de Université Johns-Hopkins
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
À propos du Spécialisation Science des données génomiques
With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome.
This Specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, along with a variety of software implementation tools like Python, R, Bioconductor, and Galaxy.
This Specialization is designed to serve as both a standalone introduction to genomic data science or as a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics, for scientists in these fields seeking to gain familiarity in data science and statistical tools to better interact with the data in their everyday work.
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Foire Aux Questions
Quand aurai-je accès aux vidéos de cours et aux devoirs ?
Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.
À quoi ai-je droit si je m'abonne à cette Spécialisation ?
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