We will learn computational methods -- algorithms and data structures -- for analyzing DNA sequencing data. We will learn a little about DNA, genomics, and how DNA sequencing is used. We will use Python to implement key algorithms and data structures and to analyze real genomes and DNA sequencing datasets.
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Université Johns-HopkinsÀ propos de ce cours
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- Bioinformatics Algorithms
- Algorithms
- Python Programming
- Algorithms On Strings
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Programme de cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
4 heures pour terminer
DNA sequencing, strings and matching
4 heures pour terminer
19 vidéos (Total 112 min), 7 lectures, 2 quiz
3 heures pour terminer
Preprocessing, indexing and approximate matching
3 heures pour terminer
15 vidéos (Total 114 min), 1 lecture, 2 quiz
3 heures pour terminer
Edit distance, assembly, overlaps
3 heures pour terminer
13 vidéos (Total 92 min), 1 lecture, 2 quiz
3 heures pour terminer
Algorithms for assembly
3 heures pour terminer
13 vidéos (Total 83 min), 1 lecture, 2 quiz
Avis
- 5 stars80,48 %
- 4 stars14,87 %
- 3 stars3,17 %
- 2 stars0,48 %
- 1 star0,97 %
Meilleurs avis pour ALGORITHMS FOR DNA SEQUENCING
par AK6 févr. 2018
This is by far the hardest and most organized. My coding skills have improved greatly. The codes are explained very well. I definitely recommend it!
par MD9 nov. 2016
This was really fun. Really enjoyed the a-ha of the algorithms and the fun of solving the alignment and assembly problems. Feel mildly powerful after assembling a virus genome.
par NF9 mars 2021
very engaging and well-presented course material.
intermediate difficulty while conveying the basics of how even recent real-world genome alignment and assembly tools work. great course design!
par LJ14 mars 2016
I had a lot of fun doing the little programming assignments in this course. I did not know I like algorithms this much. The pace is good and it is well taught.
Foire Aux Questions
Quand aurai-je accès aux vidéos de cours et aux devoirs ?
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