Access Bioinformatics Databases with Biopython

Offert par
Coursera Project Network
Dans ce Projet guidé, vous :

Sequence alignment using NCBI-BLAST

Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY

Access KEGG pathways and genes

Clock1 hour
IntermediateIntermédiaire
CloudAucun téléchargement requis
VideoVidéo en écran partagé
Comment DotsAnglais
LaptopOrdinateur de bureau uniquement

In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython. You will also interact with various bioinformatics file formats such as FASTA, PDB, GENBANK and XML along with various parsers to read and modify these files using Biopython. Note: This course works best for learners who are based in the North America region. We’re currently working on providing the same experience in other regions.

Les compétences que vous développerez

BioinformaticsPython Programmingaccess biological database

Apprendrez étape par étape

Votre enseignant(e) vous guidera étape par étape, grâce à une vidéo en écran partagé sur votre espace de travail :

  1. Sequence alignment using NCBI-BLAST

  2. Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ

  3. Fetch proteins from PDB

  4. PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY

  5. Access KEGG database

Comment fonctionnent les projets guidés

Votre espace de travail est un bureau cloud situé dans votre navigateur, aucun téléchargement n'est requis.

Votre enseignant(e) vous guide étape par étape dans une vidéo en écran partagé

Foire Aux Questions

Foire Aux Questions

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