À propos de ce cours
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Approx. 21 heures pour terminer

Recommandé : 5 hours/week...
Langues disponibles

Anglais

Sous-titres : Anglais
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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
Heures pour terminer
5 heures pour terminer

Introduction to Reproducible Research and Dynamic Documentation

This module provides an introduction to the concepts surrounding reproducibility and the Open Science movement, RStudio and GitHub, and foundational cases and authors in the field. ...
Reading
11 vidéos (Total 75 min), 6 lectures, 2 quiz
Video11 vidéos
Welcome to Week 1!3 min
History and Importance of Reproducibility5 min
Dynamic Documentation and Literate Programming5 min
Components and Examples of Reproducibility8 min
R and RStudio Introduction8 min
Git and Github - Part 112 min
Git and Github - Part 213 min
Git and Github - Part 36 min
Creating Your First Document9 min
Wrap-Up41s
Reading6 lectures
Course Outline and Grading Information5 min
Articles, Resources, and File Organization Exampless
[Lecture Prep] - Links for R and RStudio1 min
R and RStudio Resources30 min
[Lecture Prep] - GIT and GitHub5 min
Books on Reproducibility and Tools of the Trade45 min
Quiz2 exercices pour s'entraîner
Practice20 min
Week 130 min
Semaine
2
Heures pour terminer
4 heures pour terminer

R Markdown: Syntax, Document, and Presentation Formats

This module explores the R Markdown syntax to format and customize the layout of presentations or reports and will also look at inserting and creating objects such as tables, images, or video within documents....
Reading
8 vidéos (Total 83 min), 11 lectures, 2 quiz
Video8 vidéos
Introduction to R Markdown and the YAML Header10 min
R Markdown Syntax13 min
Figures, Tables, and Equations14 min
Images, Videos, and Footnotes9 min
Presentation Formats16 min
Book Format16 min
Wrap-Up1 min
Reading11 lectures
[Lecture Prep] - Links for R Markdown and YAML1 min
[Lecture Prep] - R Markdown File1 min
R Markdown Resources30 min
Resources for Tables and Equations25 min
[Lecture Prep] - Media and R Markdown Files1 min
Resource for Embedding Videos5 min
[Lecture Prep] - R Markdown File1 min
Resources for the Presentation Format25 min
[Lecture Prep] - Link for Bookdown Demo3 min
Resources for the Book Format25 min
[Graded Quiz Prep] - Week 2 Instructions5 min
Quiz2 exercices pour s'entraîner
Practice20 min
Week 240 min
Semaine
3
Heures pour terminer
4 heures pour terminer

R Markdown Templates: Processing and Customizing

This module goes further with R Markdown to help turn documents, reports, and presentations into templates for easier automation, reproducibility, and customization....
Reading
9 vidéos (Total 93 min), 6 lectures, 2 quiz
Video9 vidéos
Customizing an HTML Document20 min
Customizing a WORD Document8 min
Customizing Other Document Formats10 min
Working with R Packages12 min
Building a Document Template, Part 112 min
Building a Document Template, Part 210 min
Adding Parameters in a Document Template15 min
Wrap-Up58s
Reading6 lectures
[Lecture Prep] - CSS File1 min
Note on MD files3 min
Resources for Customizing Documents40 min
[Lecture Prep] - R Script File1 min
[Lecture Prep] - Code File1 min
Resources for Parameters and Template Developments
Quiz2 exercices pour s'entraîner
Practice20 min
Week 330 min
Semaine
4
Heures pour terminer
3 heures pour terminer

Leveraging Custom Templates from Leading Scientific Journals

This module delves into custom templates available for websites, books, and scientific publishers, such as Elsevier and the IEEE, with the chance to create your first R Package....
Reading
6 vidéos (Total 47 min), 3 lectures, 2 quiz
Video6 vidéos
Examples and Demo of Existing Templates10 min
Exploring R Packages and Their Components and Files12 min
Create an R Markdown Template and Share It10 min
Create an R Package with an R Markdown Template11 min
Wrap-Up44s
Reading3 lectures
Custom Template Packages and Referencess
Resources for Packages and Forking Repositories30 min
[Lecture Prep] - Code File1 min
Quiz2 exercices pour s'entraîner
Practice20 min
Week 430 min

Enseignant

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Melinda Higgins

Associate Research Professor/Senior Biostatistician
School of Nursing

À propos de Emory University

Emory University, located in Atlanta, Georgia, is one of the world's leading research universities. Its mission is to create, preserve, teach and apply knowledge in the service of humanity....

Foire Aux Questions

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