How do we infer which genes orchestrate various processes in the cell? How did humans migrate out of Africa and spread around the world? In this class, we will see that these two seemingly different questions can be addressed using similar algorithmic and machine learning techniques arising from the general problem of dividing data points into distinct clusters.
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Spécialisation BioinformatiqueUniversité de Californie à San DiegoÀ propos de ce cours
7,698 consultations récentes
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33%
ont bénéficié d'un avantage concret dans leur carrières grâce à ce cours
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Niveau débutant
Approx. 10 heures pour terminer
Anglais
Sous-titres : Français, Portugais (brésilien), Russe, Anglais, Espagnol
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Université de Californie à San Diego
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
5 heures pour terminer
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for <strong>clustering </strong>a set of data points will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>
5 heures pour terminer
5 vidéos (Total 33 min), 2 lectures, 3 quiz
5 vidéos
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6 min
Gene Expression Matrices 6 min
Clustering as an Optimization Problem 10 min
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5 min
2 lectures
Course Details10 min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 1 Quiz20 min
4 heures pour terminer
Week 2: Advanced Clustering Techniques
<p>Welcome to week 2 of class!</p>
4 heures pour terminer
5 vidéos (Total 35 min), 1 lecture, 3 quiz
5 vidéos
From Hard to Soft Clustering 11 min
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4 min
Expectation Maximization 7 min
Soft k-Means Clustering 3 min
Hierarchical Clustering 7 min
1 lecture
Week 2 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 2 Quiz15 min
1 heure pour terminer
Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics
1 heure pour terminer
2 lectures
2 lectures
Statement on This Week's Material10 min
How Have Humans Populated the Earth?10 min
1 exercice pour s'entraîner
Week 3 Quiz30 min
Avis
Meilleurs avis pour GENOMIC DATA SCIENCE AND CLUSTERING (BIOINFORMATICS V)
par DD23 oct. 2019
Truly awesome. What I liked best was that this course didn't have a peer reviewed final challenge, so I didn't have to wait months until my work was graded :)
par QW21 mai 2017
The first two week was very good, but for week 3 I don't see the content has any connection with Genomic Data Science.
par MK14 mai 2020
Very interesting course! So inspiring :) Recommend for everyone who interested in bioinformatic
par JM21 mars 2020
Really enjoyed the clustering chapters and the practical exercises with the yeast dataset
À propos du Spécialisation Bioinformatique
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Foire Aux Questions
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- Le cours propose peut-être « Cours complet, aucun certificat » à la place. Cette option vous permet de voir tous les contenus de cours, de soumettre les évaluations requises et d'obtenir une note finale. Cependant, vous ne pourrez pas acheter une expérience de certificat.
À quoi ai-je droit si je m'abonne à cette Spécialisation ?
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D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.
