How do we infer which genes orchestrate various processes in the cell? How did humans migrate out of Africa and spread around the world? In this class, we will see that these two seemingly different questions can be addressed using similar algorithmic and machine learning techniques arising from the general problem of dividing data points into distinct clusters.
Ce cours fait partie de la Spécialisation Bioinformatique
Offert par
Spécialisation BioinformatiqueUniversité de Californie à San DiegoÀ propos de ce cours
8,417 consultations récentes
Résultats de carrière des étudiants
33%
ont bénéficié d'un avantage concret dans leur carrières grâce à ce cours
Certificat partageable
Obtenez un Certificat lorsque vous terminez
100 % en ligne
Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.
Cours 5 sur 7 dans le
Dates limites flexibles
Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.
Niveau débutant
Approx. 9 heures pour terminer
Anglais
Sous-titres : Anglais
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Niveau débutant
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Offert par
Université de Californie à San Diego
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
5 heures pour terminer
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for <strong>clustering </strong>a set of data points will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>
5 heures pour terminer
5 vidéos (Total 33 min), 2 lectures, 3 quiz
5 vidéos
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6 min
Gene Expression Matrices 6 min
Clustering as an Optimization Problem 10 min
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5 min
2 lectures
Course Details10 min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 1 Quiz20 min
4 heures pour terminer
Week 2: Advanced Clustering Techniques
<p>Welcome to week 2 of class!</p>
4 heures pour terminer
5 vidéos (Total 35 min), 1 lecture, 3 quiz
5 vidéos
From Hard to Soft Clustering 11 min
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4 min
Expectation Maximization 7 min
Soft k-Means Clustering 3 min
Hierarchical Clustering 7 min
1 lecture
Week 2 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 2 Quiz15 min
1 heure pour terminer
Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics
1 heure pour terminer
2 lectures
2 lectures
Statement on This Week's Material10 min
How Have Humans Populated the Earth?10 min
1 exercice pour s'entraîner
Week 3 Quiz10 min
Avis
Meilleurs avis pour GENOMIC DATA SCIENCE AND CLUSTERING (BIOINFORMATICS V)
par DD23 oct. 2019
Truly awesome. What I liked best was that this course didn't have a peer reviewed final challenge, so I didn't have to wait months until my work was graded :)
par QW21 mai 2017
The first two week was very good, but for week 3 I don't see the content has any connection with Genomic Data Science.
par MK14 mai 2020
Very interesting course! So inspiring :) Recommend for everyone who interested in bioinformatic
par JM21 mars 2020
Really enjoyed the clustering chapters and the practical exercises with the yeast dataset
À propos du Spécialisation Bioinformatique
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
Foire Aux Questions
Quand aurai-je accès aux vidéos de cours et aux devoirs ?
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À quoi ai-je droit si je m'abonne à cette Spécialisation ?
Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.
Quelle est la politique de remboursement ?
Si vous vous abonnez, vous bénéficiez d'une période d'essai gratuite de 7 jours, durant laquelle vous pouvez annuler votre abonnement sans pénalité. Ensuite, nous n'accordons plus de remboursements, mais vous pouvez annuler votre abonnement à tout instant. Consultez notre politique de remboursement complète.
Une aide financière est-elle possible ?
Oui, Coursera offre une Aide Financière aux étudiants qui n'ont pas les moyens d'acquitter les frais. Demandez-la en cliquant sur le lien Aide Financière sous le bouton S'inscrire situé à gauche. Vous devrez remplir un formulaire de demande et vous serez averti(e) si elle est acceptée. Vous devrez répéter cette procédure pour chaque cours de la Spécialisation, y compris pour le Projet Final. En savoir plus.
Puis-je obtenir des crédits universitaires si je réussis le Cours ?
Ce Cours n'est pas associé à des crédits universitaires, mais certaines universités peuvent décider d'accepter des Certificats de Cours pour des crédits. Vérifiez-le auprès de votre établissement pour en savoir plus. Les Diplômes en ligne et les Certificats Mastertrack™ sur Coursera apportent la possibilité d'obtenir des crédits universitaires.
D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.
