À propos de ce cours
4.2
42 notes
10 avis
Spécialisation

Cours 5 sur 7 dans le

100 % en ligne

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Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.
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Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.
Niveau débutant

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Heures pour terminer

Approx. 9 heures pour terminer

Recommandé : 7 hours/week...
Langues disponibles

Anglais

Sous-titres : Anglais
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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
Heures pour terminer
5 heures pour terminer

Week 1: Introduction to Clustering Algorithms

<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for&nbsp;<strong>clustering&nbsp;</strong>a set of data points&nbsp;will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? &nbsp;Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>...
Reading
5 vidéos (Total 33 min), 2 lectures, 3 quiz
Video5 vidéos
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6 min
Gene Expression Matrices 6 min
Clustering as an Optimization Problem 10 min
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5 min
Reading2 lectures
Course Details10 min
Week 1 FAQs (Optional)0
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Week 1 Quiz20 min
Semaine
2
Heures pour terminer
4 heures pour terminer

Week 2: Advanced Clustering Techniques

<p>Welcome to week 2 of class!</p> <p>This week, we will see how we can move from a "hard" assignment of points to clusters toward a "soft" assignment that allows the boundaries of the clusters to blend. We will also see how to adapt the Lloyd algorithm that we encountered in the first week in order to produce an algorithm for soft clustering. We will also see another clustering algorithm called "hierarchical clustering" that groups objects into larger and larger clusters.</p>...
Reading
5 vidéos (Total 35 min), 1 lecture, 3 quiz
Video5 vidéos
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4 min
Expectation Maximization 7 min
Soft k-Means Clustering 3 min
Hierarchical Clustering 7 min
Reading1 lecture
Week 2 FAQs (Optional)0
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Week 2 Quiz15 min
Semaine
3
Heures pour terminer
1 heure pour terminer

Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics

...
Reading
2 lectures, 1 quiz
Reading2 lectures
Statement on This Week's Material10 min
How Have Humans Populated the Earth?10 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Week 3 Quiz10 min
4.2
10 avisChevron Right
Avantage de carrière

83%

a bénéficié d'un avantage concret dans sa carrière grâce à ce cours

Meilleurs avis

par HWJun 10th 2017

the part about EM is the best I know, and first time I understand the EM algorithm.

par MKNov 11th 2018

Absolutely fantastic course. Kudos to the course creators.

Enseignants

Avatar

Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering
Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

À propos de University of California San Diego

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

À propos de la Spécialisation Bioinformatics

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
Bioinformatics

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.