À propos de ce cours
4.6
13 notes
3 avis
Spécialisation

Course 7 of 7 in the

100 % en ligne

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Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.
Dates limites flexibles

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Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.
Niveau débutant

Niveau débutant

Heures pour terminer

Approx. 17 heures pour terminer

Recommandé : 3 weeks of study, 3-4 hours/week...
Langues disponibles

Anglais

Sous-titres : Anglais
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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
Heures pour terminer
5 heures pour terminer

Week 1: Identifying the Culprit in a Food Poisoning Outbreak

This week, we will apply genome sequencing algorithms to identify the bacterium causing a deadly food poisoning outbreak....
Reading
4 lectures, 1 quiz
Reading4 lectures
Welcome to Class!10 min
Special Thanks2 min
Introduction15 min
Databases and Tools5 min
Semaine
2
Heures pour terminer
4 heures pour terminer

Week 2: Comparing Gene Expression in Tissue Samples with RNA-Seq

In this week's Application Challenge, we will learn how RNA-Sequencing can be applied to perform tissue-level gene expression analysis. In particular, which is more similar on a gene expression level: different tissues from the same organism, or analogous tissues from related species? This question was the subject of recent debate and a Twitter controversy -- read more to find out!...
Reading
2 lectures, 1 quiz
Reading2 lectures
Introduction15 min
Databases and Tools5 min
Semaine
3
Heures pour terminer
5 heures pour terminer

Week 3: Weighing the Pros and Cons of Whole Genome and Whole Exome Sequencing on a Human Sample

Comparing the differences between sequencing an entire human genome and sequencing only the exome, or the DNA that is eventually translated into protein. Can we obtain a complete picture of someone's genetic disease predispositions from only the exome, or is there information lurking in introns that can provide doctors with vital information? How do we weigh the trade-offs when considering genome and exome sequencing?...
Reading
4 lectures, 1 quiz
Reading4 lectures
Introduction15 min
Databases and Tools10 min
Walkthroughs15 min
Reading: Part 3 FAQs0

Enseignants

Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering
Avatar

Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering

À propos de University of California San Diego

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

À propos de la Spécialisation Bioinformatics

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
Bioinformatics

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.