À propos de ce cours
4.7
646 notes
148 avis
100 % en ligne

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Dates limites flexibles

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Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.
Niveau débutant

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Heures pour terminer

Approx. 13 heures pour terminer

Recommandé : 12-18 hours videos and labs...
Langues disponibles

Anglais

Sous-titres : Anglais

Compétences que vous acquerrez

Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics
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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
Heures pour terminer
3 heures pour terminer

NCBI/Blast I

In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. ...
Reading
4 vidéos (Total 52 min), 4 lectures, 1 quiz
Video4 vidéos
Lecture25 min
Lab Discussion24 min
Summary0
Reading4 lectures
Acknowledgements10 min
Course Logistics10 min
Lecture Materials10 min
Lab 1 -- Exploring NCBI30 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Lab 1 Quiz6 min
Semaine
2
Heures pour terminer
3 heures pour terminer

Blast II/Comparative Genomics

In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are....
Reading
4 vidéos (Total 58 min), 2 lectures, 1 quiz
Video4 vidéos
Lecture32 min
Lab Discussion23 min
Summary0
Reading2 lectures
Lecture Materials10 min
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics30 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Lab 2 Quiz6 min
Semaine
3
Heures pour terminer
2 heures pour terminer

Multiple Sequence Alignments

In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example....
Reading
4 vidéos (Total 42 min), 2 lectures, 1 quiz
Video4 vidéos
Lecture23 min
Lab Discussion16 min
Summary0
Reading2 lectures
Lecture Materials10 min
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment30 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Lab 3 Quiz6 min
Semaine
4
Heures pour terminer
10 minutes pour terminer

Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments

...
Reading
1 quiz
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Quiz: Modules 1-310 min
4.7
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Orientation de carrière

18%

a commencé une nouvelle carrière après avoir terminé ces cours
Avantage de carrière

83%

a bénéficié d'un avantage concret dans sa carrière grâce à ce cours
Promotion de carrière

25%

a obtenu une augmentation de salaire ou une promotion

Meilleurs avis

par EDApr 27th 2017

Great course. All lectures provide a biological context for the tools you learn in the labs. The labs themselves provide a great introduction to the many tools available for bioinformatic analysis.

par RGNov 5th 2017

I enjoyed doing the course. It is exciting to see how much one can learn from a few gene or protein sequences. Thank you for making the course understandable to a beginner in bioinformatics!

Enseignant

Avatar

Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

À propos de University of Toronto

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

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