À propos de ce cours
4.7
705 notes
157 avis

100 % en ligne

Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.

Dates limites flexibles

Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.

Niveau débutant

Approx. 13 heures pour terminer

Recommandé : 12-18 hours videos and labs...

Anglais

Sous-titres : Anglais

Compétences que vous acquerrez

Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics

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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
3 heures pour terminer

NCBI/Blast I

In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. ...
4 vidéos (Total 52 min), 4 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Lecture25 min
Lab Discussion24 min
Summary
4 lectures
Acknowledgements10 min
Course Logistics10 min
Lecture Materials10 min
Lab 1 -- Exploring NCBI30 min
1 exercice pour s'entraîner
Lab 1 Quiz6 min
Semaine
2
3 heures pour terminer

Blast II/Comparative Genomics

In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are....
4 vidéos (Total 58 min), 2 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Lecture32 min
Lab Discussion23 min
Summary
2 lectures
Lecture Materials10 min
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics30 min
1 exercice pour s'entraîner
Lab 2 Quiz6 min
Semaine
3
2 heures pour terminer

Multiple Sequence Alignments

In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example....
4 vidéos (Total 42 min), 2 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Lecture23 min
Lab Discussion16 min
Summary
2 lectures
Lecture Materials10 min
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment30 min
1 exercice pour s'entraîner
Lab 3 Quiz6 min
Semaine
4
10 minutes pour terminer

Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments

...
1 quiz
1 exercice pour s'entraîner
Quiz: Modules 1-310 min
4.7
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29%

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20%

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Meilleurs avis

par EDApr 27th 2017

Great course. All lectures provide a biological context for the tools you learn in the labs. The labs themselves provide a great introduction to the many tools available for bioinformatic analysis.

par FJFeb 6th 2017

The videos were very clear on how to use various bioinformatic tools. I found no difficulty in understanding them. Really enjoyed the course. Looking forward to the next part of this course!

Enseignant

Avatar

Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

À propos de Université de Toronto

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous achetez un Certificat, vous bénéficiez d'un accès à tout le contenu du cours, y compris les devoirs notés. Lorsque vous avez terminé et réussi le cours, votre Certificat électronique est ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.