In this capstone project course, we'll compare genome sequences of COVID-19 mutations to identify potential areas a drug therapy can look to target. The first step in drug discovery involves identifying target subsequences of theirs genome to target. We'll start by comparing the genomes of virus mutations to look for similarities. Then, we'll perform PCA to cut down our number of dimensions and identify the most common features. Next, we'll use K-means clustering in Python to find the optimal number of groups and trace the lineage of the virus. Finally, we'll predict similarity between the sequences and use this to pick a target subsequence. Throughout the course, each section will consist of a programming assignment coupled with a guide video and helpful hints. By the end, you'll be well on your way to discovering ways to combat disease with genome sequencing.
Ce cours fait partie de la Spécialisation AI for Scientific Research
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Dates limites flexibles
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Certificat partageable
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100 % en ligne
Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.
Cours 4 sur 4 dans le
Niveau intermédiaire
We recoomend that you take the other two courses in the specizliation (or are familiar with the content) before attempting this capstone project.
Approx. 12 heures pour terminer
Anglais
Ce que vous allez apprendre
Analyzing genome sequences to find similarities and identify target subsequences using predctive models.
Compétences que vous acquerrez
- Whole Genome Sequencing
- Machine Learning
- Drug Discovery
- Dimensionality Reduction
- K-Means Clustering
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Programme de cours : ce que vous apprendrez dans ce cours
3 heures pour terminer
Comparing Genome Sequences
3 heures pour terminer
4 vidéos (Total 7 min)
3 heures pour terminer
Principal Component Analysis on Genome Sequences
3 heures pour terminer
2 vidéos (Total 3 min), 1 lecture, 1 quiz
3 heures pour terminer
Feature Analysis using K-Means Clustering
3 heures pour terminer
2 vidéos (Total 2 min)
3 heures pour terminer
Predicting Bit Score to Find Sequence Matches
3 heures pour terminer
2 vidéos (Total 3 min)
À propos du Spécialisation AI for Scientific Research

Foire Aux Questions
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