À propos de ce cours

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Niveau intermédiaire

None required but you should be familiar with basic aspects of plant and molecular biology. Bioinformatic Methods I and II would be good preparation

Approx. 11 heures pour terminer

Recommandé : 6 weeks of hands-on study, plus 2 evaluation weeks. The hands-on modules will take 2-4 hours of time...

Anglais

Sous-titres : Anglais

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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1

Semaine 1

3 heures pour terminer

Plant Genomic Databases, and useful sites for info about proteins

3 heures pour terminer
4 vidéos (Total 44 min), 4 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Mini-lecture17 min
Lab Discussion23 min
Summary1 min
4 lectures
Acknowledgements10 min
Course Logistics10 min
Mini-lecture Notes10 min
Lab 1 -- Plant Genomic Databases and Tools for Exploring Protein Information1h 30min
1 exercice pour s'entraîner
Lab Quiz 1
Semaine
2

Semaine 2

2 heures pour terminer

Expression Analysis

2 heures pour terminer
4 vidéos (Total 38 min), 2 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Mini-lecture17 min
Lab Discussion18 min
Summary50s
2 lectures
Mini-lecture Notes10 min
Lab 2 -- Expression Analysis1h 30min
1 exercice pour s'entraîner
Lab Quiz 2
Semaine
3

Semaine 3

2 heures pour terminer

Coexpression Tools

2 heures pour terminer
4 vidéos (Total 29 min), 2 lectures, 1 quiz
4 vidéos
Mini-lecture9 min
Lab Discussion16 min
Summary49s
2 lectures
Mini-lecture Notes10 min
Lab 3 -- Coexpression Tools1h 30min
1 exercice pour s'entraîner
Lab Quiz 3
Semaine
4

Semaine 4

Sectional Quiz 1

1 exercice pour s'entraîner
Sectional Quiz 1

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Université de Toronto

À propos du Spécialisation Plant Bioinformatic Methods

The past 15 years have been exciting ones in plant biology. Hundreds of plant genomes have been sequenced, RNA-seq has enabled transcriptome-wide expression profiling, and a proliferation of "-seq"-based methods has permitted protein-protein and protein-DNA interactions to be determined cheaply and in a high-throughput manner. These data sets in turn allow us to generate hypotheses at the click of a mouse or tap of a finger.The Plant Bioinformatics Specialization on Coursera introduces core bioinformatic competencies and resources, such as NCBI's Genbank, Blast, multiple sequence alignments, phylogenetics in Bioinformatic Methods I, followed by protein-protein interaction, structural bioinformatics and RNA-seq analysis in Bioinformatic Methods II. In Plant Bioinformatics we cover 33 plant-specific online tools from genome browsers to transcriptomic data mining to promoter/network analyses and others. Last, a Plant Bioinformatics Capstone uses these tools to hypothesize a biological role for a gene of unknown function, summarized in a written lab report.This specialization is useful to any modern plant molecular biologist wanting to get a feeling for the incredible scope of data available to researchers. A small amount of R programming is introduced in Bioinformatic Methods II, but most of the tools are web applications. It is recommended that you have access to a laptop or desktop computer for running these as they may not work as mobile applications on your phone or tablet....
Plant Bioinformatic Methods

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.