À propos de ce cours
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Approx. 20 heures pour terminer

Recommandé : 1-2 hours/week...
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Anglais

Sous-titres : Anglais
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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
Heures pour terminer
2 heures pour terminer

Introduction and History of Bioinformatics

Welcome to “Bioinformatics: Introduction and Methods! Upon completion of this module you will be able to: become familiar with the essential concepts of bioinformatics; explore the history of this young area; experience how rapidly bioinformatics is growing. Our supplementary materials will give you a better understanding of the course lectures through they are not required in quizzes or exams...
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4 videos (Total 69 min), 2 lectures, 1 quiz
Video4 vidéos
History of Bioinformatics30 min
Bioinformatics in Mainland China8 min
About This Course9 min
Reading2 lectures
Readings10 min
Slides10 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Introduction and History of Bioinformatics20 min
Semaine
2
Heures pour terminer
2 heures pour terminer

Sequence Alignment

Upon completion of this module, you will be able to: describe dynamic programming based sequence alignment algorithms; differentiate between the Needleman-Wunsch algorithm for global alignment and the Smith-Waterman algorithm for local alignment; examine the principles behind gap penalty and time complexity calculation which is crucial for you to apply current bioinformatic tools in your research; experience the discovery of Smith-Waterman algorithm with Dr. Michael Waterman himself....
Reading
7 videos (Total 99 min), 2 lectures, 1 quiz
Video7 vidéos
Global Alignment by Dynamic Programming14 min
From Global to Local6 min
Alignment with Affine Gap Penalty and Calculation of Time Complexity of The Needleman-Wunsch Algorithm6 min
Interview with M. S. Waterman Waterman29 min
Supplement on Homology & Similarity, Similarity Matrix and Dot Matrix (English Subtitles)10 min
Student Presentation (English Subtitles)18 min
Reading2 lectures
Readings10 min
Slides10 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Sequence Alignment18 min
Semaine
3
Heures pour terminer
1 heure pour terminer

Sequence Database Search

Upon completion of this module, you will be able to: become familiar with sequence databse search and most common databases; explore the algoritm behind BLAST and the evaluation of BLAST results; ajdust BLAST parameters base on your own research project....
Reading
3 videos (Total 41 min), 2 lectures, 1 quiz
Video3 vidéos
BLAST Algorithm: A Primer13 min
Student Presentation (English Subtitles)15 min
Reading2 lectures
Readings10 min
Slides10 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Sequence Database Search10 min
Semaine
4
Heures pour terminer
1 heure pour terminer

Markov Model

Upon completion of this module, you will be able to: recognize state transitions, Markov chain and Markov models; create a hidden Markov model by yourself; make predictuions in a real biological problem with hidden Markov model....
Reading
4 videos (Total 47 min), 2 lectures, 1 quiz
Video4 vidéos
Hidden Markov Model11 min
Predict with Hidden Markov Model10 min
Student Presentation16 min
Reading2 lectures
Readings10 min
Slides10 min
Quiz1 exercice pour s'entraîner
Markov Model 14 min

Enseignants

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Ge Gao 高歌, Ph.D.

Assistant Professor, Principle Investigator
Center for Bioinformatics, School of Life Science
Avatar

Liping Wei 魏丽萍, Ph.D.

Professor, Director
Center for Bioinformatics, School of Life Sciences

À propos de Peking University

Peking University is determined to make its education openly accessible to students in China and around the world. With over 3000 faculty members, Peking University offers excellence in teaching and learning. Founded in 1898, Peking University (PKU) was the first national comprehensive university in China. For the past 115 years, with its hundreds of thousands of outstanding alumni, Peking University has made prominent contributions in the humanities and sciences to further China's prosperity and progress....

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous achetez un Certificat, vous bénéficiez d'un accès à tout le contenu du cours, y compris les devoirs notés. Lorsque vous avez terminé et réussi le cours, votre Certificat électronique est ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.