3D SARS-CoV-19 Protein Visualization With Biopython

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Dans ce projet guidé, vous :

Biological sequence/ Data manipulation with Biopython

Query Biological Databases using Biopython & web-scraping

Create an interactive 3D model of SARS-CoV-19 Protein

Clock2 hours
CloudAucun téléchargement requis
VideoVidéo en écran partagé
Comment DotsAnglais
LaptopOrdinateur de bureau uniquement

In this project you will create an interactive three-dimensional (3D) representation of SARS-CoV-19 (Coronavirus) protein structures & publication-quality pictures of the same, understand properties of SARS-CoV-19 genome, handle biological sequence data stored in FASTA & PDB (Protein Data Bank) and XML format, and get insights from this data using Biopython. This hands-on project will also give you a glimpse of tasks a Bioinformatician performs on a daily basis, along with the up-to-date concepts and database use cases in the field of Medical Research and Human genetics. In this project, we will also cover basics about important databases used by biologists and biotechnologists, along with the type of sequence data we can access and visualize from these databases using Biopython & Jupyter notebook.

Les compétences que vous développerez

SARS-CoV-19BiopythonPython ProgrammingBioinformaticsBiotechnology

Apprendrez étape par étape

Votre enseignant(e) vous guidera étape par étape, grâce à une vidéo en écran partagé sur votre espace de travail :

  1. Introduction to Biopython

  2. Understand FASTA file format

  3. Sequence manipulation using Biopython

  4. Transcription & Translation studies

  5. Perform Basic Local Alignment using NCBI-BLAST

  6. Reading PDB file

  7. Visualizing SARS-CoV-19 Protein structures

Comment fonctionnent les projets guidés

Votre espace de travail est un bureau cloud situé dans votre navigateur, aucun téléchargement n'est requis.

Votre enseignant(e) vous guide étape par étape dans une vidéo en écran partagé



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