We will learn computational methods -- algorithms and data structures -- for analyzing DNA sequencing data. We will learn a little about DNA, genomics, and how DNA sequencing is used. We will use Python to implement key algorithms and data structures and to analyze real genomes and DNA sequencing datasets.
Lecture: Variations on k-mer indexes
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En provenance du cours de Johns Hopkins University
Algorithms for DNA Sequencing
Johns Hopkins University
Cours 4 sur 8 dans Specialization Genomic Data Science
À partir de la leçon
Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching
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Computer Science
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Department of Computer Science
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