À propos de ce cours
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Niveau débutant

Approx. 12 heures pour terminer

Recommandé : This course will run over 5 weeks, 2-3 hours a week...

Anglais

Sous-titres : Anglais

Compétences que vous acquerrez

NucleotideAntimicrobialGenomeMicrobiology

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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
1 heure pour terminer

Module 1

Welcome and introduction to typing of bacteria and use of Whole genome sequencing applied to surveillance of bacterial pathogens and antimicrobial resistance...
3 vidéos (Total 32 min), 1 quiz
3 vidéos
General Principles of typing of bacteria12 min
Surveillance of Antimicrobial Resistance using whole genome sequencing12 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 120 min
Semaine
2
1 heure pour terminer

Module 2

Introduction to Next Generation sequencing...
3 vidéos (Total 37 min), 1 quiz
3 vidéos
Introduction to Next-Generation sequencing (NGS)19 min
De novo assembly- from raw reads to contigs: assembler tool description and application5 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 230 min
Semaine
3
1 heure pour terminer

Module 3

Whole genome sequencing tools- demonstration of analysis tools for species identification, MLST typing and finding resistance genes...
3 vidéos (Total 30 min), 1 quiz
3 vidéos
MLST Typing: MLST tool description and applications8 min
Resistance gene detection: Resfinder tool description and applications12 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 320 min
Semaine
4
1 heure pour terminer

Module 4

Whole genome sequencing tools- demonstration of analysis tools for Serotyping of Salmonella and Escherichia coli strains , and finding plasmid replicons...
3 vidéos (Total 24 min), 1 quiz
3 vidéos
E. coli serotype identification: serotype finder tool description and applications6 min
Plasmid replicon identification and plasmid typing12 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 420 min
4.6
62 avisChevron Right

38%

a commencé une nouvelle carrière après avoir terminé ces cours

29%

a bénéficié d'un avantage concret dans sa carrière grâce à ce cours

12%

a obtenu une augmentation de salaire ou une promotion

Meilleurs avis

par VLJan 14th 2018

This is a very interesting course, it's practical and simple to follow and I've learned a lot about whole genome sequencing and its techniques.

par EYOct 1st 2018

Good course for a beginner. Generally, help me understand whole genome sequencing of bacteria. Will follow other course that they have provide.

Enseignants

Avatar

Lina Cavaco

Ext Associate Professor
Copenhagen University- ICMM /Statens Serum Institut - Department for Bacteria, Parasites and Fungi
Avatar

Pimlapas Leekitcharoenphon

PostDoc
Research Group for Genomic Epidemiology, DTU Food

À propos de Université technique du Danemark (DTU)

DTU focuses on research in technical and natural sciences that contributes to the development of society. As an industrially orientated university, our goal is to supply high-level international research based on combining theory with constructing models and empirical methods....

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

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