À propos de ce cours
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Compétences que vous acquerrez

BioinformaticsData AnalysisGenomeGenomics

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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
1 heure pour terminer

Introduction

This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.

...
2 vidéos (Total 13 min), 4 lectures, 1 quiz
2 vidéos
Introduction to the Galaxy Platform5 min
4 lectures
Welcome10 min
Syllabus10 min
Pre-Course Survey10 min
A Note about AWS10 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 1 Quiz22 min
Semaine
2
2 heures pour terminer

Galaxy 101

In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.

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3 vidéos (Total 42 min), 1 quiz
3 vidéos
Galaxy 101: Workflows12 min
Annotation, Sharing, and Publishing13 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 2 Quiz56 min
Semaine
3
1 heure pour terminer

Working with sequence data

In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.

...
2 vidéos (Total 25 min), 1 quiz
2 vidéos
ChIP-Sequence Analysis with MACS14 min
1 exercice pour s'entraîner
Module 3 Quiz18 min
Semaine
4
4 heures pour terminer

RNA-seq & Running your own Galaxy

In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.

...
4 vidéos (Total 49 min), 2 lectures, 3 quiz
4 vidéos
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12 min
Installing Galaxy Locally8 min
Galaxy on the Cloud19 min
2 lectures
TopHat availability10 min
Post-Course Survey10 min
2 exercices pour s'entraîner
Module 4 Quiz22 min
Module 5 Quiz20 min
3.7
133 avisChevron Right

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a commencé une nouvelle carrière après avoir terminé ces cours

25%

a bénéficié d'un avantage concret dans sa carrière grâce à ce cours

Principaux examens pour Genomic Data Science with Galaxy

par GKSep 6th 2018

This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.

par BGFeb 3rd 2018

Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.

Enseignant

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James Taylor, PhD

Associate Professor of Biology and Computer Science

À propos de Université Johns-Hopkins

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

À propos de la Spécialisation Science des données génomiques

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Science des données génomiques

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

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