À propos de ce cours

6,012 consultations récentes
Certificat partageable
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Cours 6 sur 7 dans le
Dates limites flexibles
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Niveau débutant
Approx. 24 heures pour terminer
Anglais
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Université de Californie à San Diego

Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1

Semaine 1

4 heures pour terminer

Week 1: Introduction to Read Mapping

4 heures pour terminer
4 vidéos (Total 33 min), 2 lectures, 3 quiz
4 vidéos
Why Do We Map Reads? 7 min
Using the Trie 10 min
From a Trie to a Suffix Tree 11 min
2 lectures
Course Details10 min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Week 1)15 min
Semaine
2

Semaine 2

4 heures pour terminer

Week 2: The Burrows-Wheeler Transform

4 heures pour terminer
3 vidéos (Total 21 min), 1 lecture, 2 quiz
3 vidéos
Inverting Burrows-Wheeler 13 min
Using Burrows-Wheeler for Pattern Matching 2 min
1 lecture
Week 2 FAQs (Optional)
Semaine
3

Semaine 3

4 heures pour terminer

Week 3: Speeding Up Burrows-Wheeler Read Mapping

4 heures pour terminer
4 vidéos (Total 22 min), 1 lecture, 3 quiz
4 vidéos
Setting Up Checkpoints 8 min
Inexact Matching 6 min
Further Applications of Read Mapping 2 min
1 lecture
Week 3 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Weeks 2-3)20 min
Semaine
4

Semaine 4

4 heures pour terminer

Week 4: Introduction to Hidden Markov Models

4 heures pour terminer
5 vidéos (Total 42 min)
5 vidéos
Gambling with Yakuza 12 min
From a Crooked Casino to a Hidden Markov Model 9 min
The Decoding Problem 5 min
The Viterbi Algorithm 7 min

Avis

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