À propos de ce cours
10,355 consultations récentes

Cours 3 sur 7 dans le

100 % en ligne

Commencez dès maintenant et apprenez aux horaires qui vous conviennent.

Dates limites flexibles

Réinitialisez les dates limites selon votre disponibilité.

Niveau débutant

Approx. 19 heures pour terminer

Anglais

Sous-titres : Anglais

Compétences que vous acquerrez

BioinformaticsGraph TheoryBioinformatics AlgorithmsPython Programming

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Programme du cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine
1
5 heures pour terminer

Week 1: Introduction to Sequence Alignment

7 vidéos (Total 51 min), 2 lectures, 3 quiz
7 vidéos
From Sequence Comparison to Biological Insights 10 min
The Alignment Game and the Longest Common Subsequence Problem 3 min
The Manhattan Tourist Problem 6 min
The Change Problem 10 min
Dynamic Programming and Backtracking Pointers 6 min
From Manhattan to the Alignment Graph 9 min
2 lectures
Course Details10 min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 1 Quiz15 min
Semaine
2
2 heures pour terminer

Week 2: From Finding a Longest Path to Aligning DNA Strings

1 vidéo (Total 11 min), 1 lecture, 3 quiz
1 lecture
Week 2 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 2 Quiz15 min
Semaine
3
4 heures pour terminer

Week 3: Advanced Topics in Sequence Alignment

3 vidéos (Total 29 min), 1 lecture, 3 quiz
3 vidéos
Space-Efficient Sequence Alignment 10 min
Multiple Sequence Alignment 13 min
1 lecture
Week 3 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 3 Quiz15 min
Semaine
4
4 heures pour terminer

Week 4: Genome Rearrangements and Fragility

5 vidéos (Total 36 min), 1 lecture, 3 quiz
5 vidéos
Sorting by Reversals 4 min
Breakpoint Theorem 5 min
Rearrangements in Tumor Genomes 5 min
2-Breaks 7 min
1 lecture
Week 4 FAQs (Optional)
1 exercice pour s'entraîner
Week 4 Quiz15 min
4.7
20 avisChevron Right

Meilleurs avis pour Comparaison de gènes, protéines et génomes (bioinformatique III)

par AHAug 19th 2016

A very well taught course that gives you the ins and outs of sequence comparision and introduces chromosme rearrangement analysis in a succint manner. This was

par ZXJul 21st 2019

In depth and comprehensive coverage of the topics in genetic data analysis.

Enseignants

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Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering
Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering
Avatar

Nikolay Vyahhi

Visiting Scholar
Department of Computer Science and Engineering

À propos de Université de Californie à San Diego

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

À propos du Spécialisation Bioinformatique

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
Bioinformatique

Foire Aux Questions

  • Une fois que vous êtes inscrit(e) pour un Certificat, vous pouvez accéder à toutes les vidéos de cours, et à tous les quiz et exercices de programmation (le cas échéant). Vous pouvez soumettre des devoirs à examiner par vos pairs et en examiner vous-même uniquement après le début de votre session. Si vous préférez explorer le cours sans l'acheter, vous ne serez peut-être pas en mesure d'accéder à certains devoirs.

  • Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Etudiants.