Ce cours fait partie de la Spécialisation Infectious Disease Modelling

4.8
étoiles
16 évaluations

Nimalan Arinaminpathy

2 484 déjà inscrits

Offert par

Dans le cadre du diplôme Global Master of Public Health
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Spécialisation Infectious Disease ModellingImperial College London

À propos de ce cours

1 768 consultations récentes

The other two courses in this specialisation require you to perform deterministic modelling - in other words, the epidemic outcome is predictable as all parameters are fully known. However, this course delves into the many cases – especially in the early stages of an epidemic – where chance events can be influential in the future of an epidemic. So, you'll be introduced to some examples of such ‘stochasticity’, as well as simple approaches to modelling these epidemics using R. You will examine how to model infections for which such ‘population structure’ plays an important role in the transmission dynamics, and will learn some of the basic approaches to modelling vector-borne diseases, including the Ross-McDonald Model. 
Even if you are not designing and simulating mathematical models in future, it is important to be able to critically assess a model so as to appreciate its strengths and weaknesses, and identify how it could be improved. One way of gaining this skill is to conduct a critical peer review of a modelling study as a reviewer, which is an opportunity you'll get by taking this course.

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Cours 3 sur 3 dans le

Spécialisation Infectious Disease Modelling

Niveau intermédiaire

Approx. 20 heures pour terminer

Anglais

Ce que vous allez apprendre

Distinguish between stochastic and deterministic models, explain when either are appropriate, and perform simple simulations of a stochastic model
Identify where it is important to incorporate population structure in a model and design and simulate a transmission model capturing such structure
Evaluate the assumptions behind the Ross MacDonald model, and code such a model using R to simulate the dynamics of a vector-borne disease
Critically evaluate a modelling study and communicate its strengths and weaknesses to a scientifically literate audience

Compétences que vous acquerrez

Mathematical Model
R Programming
Infectious Diseases

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Spécialisation Infectious Disease Modelling

Niveau intermédiaire

Approx. 20 heures pour terminer

Anglais

Enseignant

Nimalan Arinaminpathy

Faculty of Medicine, School of Public Health

9 679 étudiants

4 cours

Offert par

Imperial College London

Imperial College London is a world top ten university with an international reputation for excellence in science, engineering, medicine and business. located in the heart of London. Imperial is a multidisciplinary space for education, research, translation and commercialisation, harnessing science and innovation to tackle global challenges.

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Ce cours fait partie du diplôme intégralement en ligne Global Master of Public Health de Imperial College London. Si vous êtes admis(e) au programme complet, vos cours sont pris en compte dans votre apprentissage diplômant.

Programme de cours : ce que vous apprendrez dans ce cours

Semaine

Semaine 1

7 heures pour terminer

Building on the SIR Model: Stochasticity

The other two courses in this specialisation have focused on performing deterministic modelling - that is, the epidemic outcome is predictable as all parameters are fully known. However, there are many cases, especially in the early stages of an epidemic, where chance events can be influential in the future of an epidemic. In this module, you will be introduced to some examples of such ‘stochasticity’, as well as, simple approaches to modelling these epidemics using R.

7 heures pour terminer

5 vidéos (Total 14 min), 8 lectures

5 vidéos

Welcome to the Course1 min

An Insider's View of IDM4 min

Stochastic and Deterministic Models2 min

Simulating Stochasticity2 min

Populations with Pre-Existing Immunity2 min

8 lectures

Welcome to Infectious Disease Modelling10 min

About the Infectious Disease Modelling Team10 min

Glossary10 min

Modelling Infectious Disease Dynamics35 min

Building on the SIR Model3 min

The Story of MERS Coronavirus10 min

Calculating Incidence in a Deterministic Model45 min

The Resurgence of Measles15 min

Semaine

Semaine 2

6 heures pour terminer

Building on the SIR model: Heterogeneity

In the basic deterministic SIR model, all susceptible individuals in a population are subject to the same risks of infection. However, there are many important infectious diseases where certain groups of the population account for a disproportionate amount of transmission: these are not always the same groups that bear the greatest amount of morbidity and mortality. In this module, you will examine how to model infections for which such ‘population structure’ plays an important role in the transmission dynamics.

6 heures pour terminer

2 vidéos (Total 7 min), 2 lectures

Semaine

Semaine 3

5 heures pour terminer

Building on the SIR model: Vector-borne Diseases

Many important diseases are not directly transmitted between hosts, but depend on ‘vectors’ to pass infection between hosts, for example biting insects. It is important to be able to extend the modelling approaches you have studied so far to capture these more complex forms of natural history. In this module, you will learn some of the basic approaches to modelling vector-borne diseases, including the Ross-McDonald model, which is a framework that provides an important foundation for such diseases.

5 heures pour terminer

6 vidéos (Total 25 min), 1 lecture

Semaine

Semaine 4

2 heures pour terminer

Assignment: Modelling Study Critique

Even if you are not designing and simulating mathematical models in future, it is important to be able to critically assess a model, to appreciate its strengths and weaknesses, and to identify how it could be improved. One way of gaining this skill is to conduct a critical peer review of a modelling study in the position of a reviewer evaluating it for publication in a journal. This module is reserved for the completion of your assignment - for you to apply the knowledge and skills you've developing throughout this specialisation.

2 heures pour terminer

Avis

4.8

10 avis

5 stars
75 %
4 stars
25 %

Meilleurs avis pour BUILDING ON THE SIR MODEL

par GC23 juin 2020

I thought it was clear, the syntax problems were about the same topic and needed the solution talked about in the videos. The subject was completely covered. I already recommended it to like 5 people.

par DG19 juin 2021

a great follow up to the R coding course and a good entree into the world of public health

par IH20 sept. 2020

A great learning opportunity. Advanced content presented in a convincing and understandable manner. Simply amazing.

par DT13 août 2020

I have found it useful for increasing my insights into infectious disease modelling.

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À propos du Spécialisation Infectious Disease Modelling

Mathematical modelling is increasingly being used to support public health decision-making in the control of infectious diseases. This specialisation aims to introduce some fundamental concepts of mathematical modelling with all modelling conducted in the programming language R - a widely used application today.

The specialisation will suit you if you have a basic working knowledge of R, but would also like to learn the necessary basic coding skills to write simple mathematical models in this language. While no advanced mathematical skills are required, you should be familiar with ordinary differential equations, and how to interpret them. You'll receive clear instruction in the basic theory of infectious disease modelling alongside practical, hands-on experience of coding models in the programming language R.

Foire Aux Questions

Quand aurai-je accès aux vidéos de cours et aux devoirs ?
L’accès à des vidéos de cours et des devoirs dépend de votre type d’inscription. Si vous suivez un cours en mode auditeur libre, vous pourrez voir la plupart des contenus de cours gratuitement. Pour accéder aux devoirs notés et obtenir un certificat, vous devrez acheter une expérience de certificat, pendant ou après avoir assister au cours en tant qu’auditeur libre. Si vous ne visualisez pas l’option auditeur libre :
Il est possible que le cours ne propose pas d’option auditeur libre. Vous pouvez en revanche accéder à un essai gratuit ou faire une demande d'aide financière.
Le cours propose peut-être « Cours complet, aucun certificat » à la place. Cette option vous permet de voir tous les contenus de cours, de soumettre les évaluations requises et d'obtenir une note finale. Cependant, vous ne pourrez pas acheter une expérience de certificat.
À quoi ai-je droit si je m'abonne à cette Spécialisation ?
Lorsque vous vous inscrivez au cours, vous bénéficiez d'un accès à tous les cours de la Spécialisation, et vous obtenez un Certificat lorsque vous avez réussi. Votre Certificat électronique est alors ajouté à votre page Accomplissements. À partir de cette page, vous pouvez imprimer votre Certificat ou l'ajouter à votre profil LinkedIn. Si vous souhaitez seulement lire et visualiser le contenu du cours, vous pouvez accéder gratuitement au cours en tant qu'auditeur libre.
Une aide financière est-elle possible ?
Oui. Dans certains programmes d’apprentissage, vous pouvez demander une aide financière ou une bourse d’études si vous ne pouvez pas payer les frais d’inscription. Si une aide financière ou une bourse d’études est disponible pour le programme d’apprentissage choisi, vous trouverez un lien pour faire une demande sur la page de description.

D'autres questions ? Visitez le Centre d'Aide pour les Étudiants.

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